Utilisation du PMSI dans l'évaluation de morbi-mortalité en chirurgie oeso-gastrique
Use of the PMSI in the evaluation of morbi-mortality in oeso-gastric surgery
par Alexandre CHALLINE sous la direction de Sandrine KATSAHIAN et de Andrea LAZZATI
Thèse de doctorat en Bioinformatique
ED 393 École doctorale Pierre Louis de santé publique : épidémiologie et sciences de l'information biomédicale

Soutenue le lundi 12 décembre 2022 à Université Paris Cité

Sujets
  • Bases de données médico-administratives
  • Jonction oesophago-gastrique
  • Revues de mortalité-morbidité
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Mots clés
Données de santé administratives, Big data, Épidémiologie, Chirurgie oesogastrique, Morbi-mortalité, Score de clavien-dindo, Volume d'activité
Resumé
La chirurgie oesogastrique, qu'elle soit réalisée pour cancer ou non, est une chirurgie a haut risque de complication et de mortalité postopératoire. En France, les oesophagectomies et les gastrectomies pour cancer ont respectivement des taux de mortalité de 8 et de 7 % a 90 jours postopératoire. Le taux de complications est aussi élevé, de l'ordre de 50 %. Cette haute morbi-mortalité explique l'objectif de la recherche en chirurgie visant a améliorer la prise en charge de ces patients. Cette recherche avance en mettant notamment en place des études randomisées mais celles-ci restent longues et difficiles a financer du fait de leur cout propre et du faible effectif de patients concernés par ce type de pathologie. Les bases médico-administratives ont été utilisées dans cette thèse pour la recherche sur ce domaine. La France possède l'une des bases les plus exhaustives au monde grâce au système de remboursement français. La branche du PMSI - ¿ Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information ¿ - a été mise a contribution. Cette base permet de colliger toute l'information concernant les hospitalisations des patients, comme, par exemple leurs pathologies et les actes réalisés. L'information de chaque patient est donc anonymisée mais permet de réaliser un suivi longitudinal en suivant leurs hospitalisations successives. Dans la première étude, nous avons étudié l'impact de la voie mini-invasive en France sur les gastrectomies pour cancer. Nous avons inclus 6 années de patients opérés en France d'une résection gastrique. L'analyse a été stratifiée sur le caractère total ou non de la gastrectomie. Après score de propension et appariement, l'impact de la cœlioscopie en comparaison a la laparotomie a été étudie sur différents critères de jugement a court terme (mortalité, morbidité, ré-intervention chirurgicale, durée d'hospitalisation) et a long terme (sténose œsophagienne, éventration post-opératoire, occlusion sur bride). Dans la seconde étude, le PMSI a été mis a contribution pour l'évaluation de la prise en charge des ingestions de produit caustique. Dans ce travail, le PMSI dévoile l'un de ces atouts principaux : l'exhaustivité de la base. Il permet l'identification de chaque patient avec le code diagnostique de brulure œsophagienne sur 10 ans, pris en charge dans chaque centre français et d'étudier son traitement. Après une analyse descriptive poussée, les facteurs de risque de mortalité et morbidité ont été étudiés. Enfin au travers de ces deux travaux, la question du volume et de son rapport avec la morbimortalité a été étudiée. Des représentations graphiques, des analyses ajustées ont été réalisées. Cette thèse illustre une partie des usages des bases de données médico-administratives dans la recherche clinique de manière pragmatique. L'implémentation du PMSI au travers du ¿ Heath data hub ¿ sera une nouvelle piste pour pouvoir suivre les patients en extrahospitalier.