Lymphocytes T régulateurs, Lymphocytes T folliculaires, Ganglions lymphatiques drainant la tumeur, Cancer du sein, Caractérisation multiomique

Les ganglions lymphatiques drainant la tumeur (GLs) sont des sites cruciaux pour l'amorçage des réponses immunitaires adaptatives anti-tumorales. Cependant, l'impact de l'invasion tumorale sur les GLs et la réponse immunitaire anti-tumorale des cellules T CD4+ reste peu étudié chez l'humain. En utilisant une analyse de haute résolution à l'échelle unicellulaire du transcriptome (scRNAseq), du récepteur des cellules T (TCR, scTCRseq) et de l'accessibilité de la chromatine (snATACseq), nous avons caractérisé les cellules T CD4+ conventionnelles (Tconv) et régulatrices (Treg) issues du sang, des GLs non envahis, des GLs envahis et des tumeurs de patientes atteintes d'un cancer du sein naïf de traitement. L'analyse comparative des deux types de tissus de GLs a révélé que les GLs envahis étaient enrichis en Tregs effecteurs et en cellules folliculaires [cellules T folliculaires auxiliaires (Tfh) et cellules T folliculaires régulatrices (Tfr)]. Les Tregs effecteurs et les cellules Tfr présentaient une expansion clonale plus importante dans les GLs envahis. Ces cellules étaient enrichies en signatures transcriptomiques associées à la spécificité des néoantigènes tumoraux et montraient une plus grande fréquence de partage de TCR entre le GL envahi et le tissu tumoral. L'analyse des motifs d'accessibilité de la chromatine a révélé que les clusters Tfr et Tfh présentaient un remodelage chromatinien plus important dans les GLs envahis. L'analyse des voies de signalisation a mis en évidence une activation accrue du TCR dans les GLs envahis, cohérente avec l'augmentation observée de la clonalité des TCR. En utilisant des techniques de transcriptomique (10x Visium) et de protéomique (Orion multiplex imaging) spatiales, nous avons également observé que l'invasion tumorale était associée à une perturbation structurelle significative des follicules et des centres germinatifs dans les GLs envahis. Ces résultats suggèrent que l'invasion des ganglions lymphatiques ne se limite pas à l'activation des cellules immunitaires mais pourrait également orienter la réponse immunitaire locale vers des voies tolérantes ou régulatrices.