Rôle du facteur de transcription ETS1 dans la différenciation des lymphocytes B
Role of the transcription factor Ets1 in B lymphocyte differentiation
par Lydie GAMA sous la direction de Jean-Christophe BORIES
Thèse de doctorat en Hématologie
ED 561 Hématologie, oncogenèse et biothérapies

Soutenue le vendredi 29 avril 2022 à Université Paris Cité

Sujets
  • Différenciation (biologie)
  • Interleukine 7
  • Lymphocytes B
  • Protéine proto-oncogène c-ets-1
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Mots clés
Lymphocyte B, ETS1, Développement précoce, IL-7R, STAT5, Progéniteur B, Souris, Marque épigénétique
Resumé
Les lymphocytes B jouent un rôle central dans la réponse immunitaire en assurant la sécrétion d'anticorps. Elles sont générées à partir de cellules souches hématopoïétiques par un processus séquentiel hautement régulé qui assure la production des lymphocytes B matures. Chez les cellules progénitrices lymphoïdes de la souris, la signalisation par le récepteur de l'interleukine 7 (IL-7R) permet l'engagement dans la lignée B, puis, consécutivement, la recombinaison des gènes des chaines lourdes des immunoglobulines (IgH) et leur expression au sein du récepteur pré-B (pré-BCR). Dans les cellules B précoces (pro-B), l'engagement de l'IL-7R active le facteur de transcription Stat5 qui régule des gènes impliqués dans la prolifération (cMyc et Ccnd3) et la survie (Mcl1 et Bcl2), tout en réprimant l'expression et la recombinaison des gènes des chaînes légères des immunoglobulines kappa (Igk). De son coté, le signal du pré-BCR active les facteurs de transcription Ikaros et Irf4 qui déclenchent l'arrêt du cycle cellulaire, le réarrangement et l'expression de Igk puis la différenciation en cellules pré-B. Bien que l'articulation fonctionnelle entre l'IL-7R et le pré-BCR soit essentielle pour la production des cellules B immunocompétentes, les mécanismes moléculaires qui modulent la fonction de l'axe IL7R/Stat5 et pré-BCR/Ikaros dans les cellules pro-B n'ont pas été entièrement élucidés. Lors de ma thèse, j'ai démontré que l'inactivation du facteur de transcription Ets1 chez la souris (Ets1-/-) altère la différenciation des cellules pro-B dans la moelle et inhibe leurs proliférations en réponse à l'IL-7 in vitro. J'ai apporté la preuve que l'engagement de l'IL-7R induit l'expression de Ets1 dans ces cellules in vitro. Mes analyses transcriptomiques indiquent que les cellules pro-B Ets1-/- expriment un ensemble de gènes, comprenant Irf4 et Igk, caractéristique des cellules pré-B. Afin de préciser le rôle de Ets1, j'ai utilisé une approche d'immuno-précipitations suivi de séquençage (ChIP-seq) pour cartographier les sites de fixation de Ets1 à l'échelle du génome dans les cellules pro-B stimulées par l'IL-7. Mes résultats révèlent l'existence d'une co-localisation entre les sites de fixation de Ets1, Stat5 et Ikaros, suggérant des liens fonctionnels entre ces facteurs de transcription. Enfin, j'ai mis en oeuvre des expériences d'Assay for Transposase-Accessible Chromatin (d'ATAC-seq) afin de caractériser les modifications dans l'accessibilité de la chromatine entre des cellules pro-B sauvages et Ets1-/-. L'analyse de ces données m'a permis de définir un ensemble de locus dont l'accessibilité dépend de l'activité de Ets1 et qui sont associés à la régulation de la différenciation des cellules pré-B. Ensemble, mes travaux révèlent une nouvelle fonction de Ets1 dans le contrôle de la différenciation des cellules B précoces et suggère un rôle majeur de ce facteur dans la coordination des réponses aux signaux des récepteurs IL7R et pré-BCR dans les cellules pro-B.