| Resumé |
Introduction : Le carcinome hépatocellulaire (CHC) est un cancer biologiquement agressif avec peu de cibles thérapeutiques optimales. La prévalence croissante de la stéatose d'origine métabolique s'ajoute à la complexité de la prise en charge du CHC dans les pays occidentalisés. Les modèles murins reflétant l'hétérogénéité moléculaire du CHC humain sont rares. La souris transgénique ASVB développe des tumeurs hépatocellulaires médiées par l'expression de l'antigène T du virus SV40. Les objectifs de ce travail étaient la caractérisation moléculaire des tumeurs ASVB et l'analyse des variations de leur phénotype au cours du temps et en fonction du régime alimentaire. Méthodes : Des souris ASVB et C57Bl/6 ont été exposées à deux régimes alimentaires ; un régime normal (régime N) et un régime expérimental hyper gras, hyper sucré et riche en cholestérol (régime SM). Les souris ont été mises à mort et leur foie prélevé à 8, 12, 16 et 20 semaines. Une analyse du transcriptome entier de leur foie a été réalisée après séquençage ARN. Les profils d'expression étaient comparés aux signatures moléculaires de la base MSigDB et aux processus biologiques décrits par les GOterms. Résultats : 48 souris, dont 32 ASVB et 16 C57Bl/6, ont été incluses dans l'analyse transcriptomique. Les souris ASVB étaient associées à un enrichissement positif des gènes cibles de E2F (score d'enrichissement normalisé (NES) =2,32 ; p<0,001) et MYC (NES=1,78 ; p<0,001). Au total 948 gènes étaient différentiellement exprimés chez la souris ASVB (par rapport à C57Bl/6) et le clustering non supervisé montrait que les gènes sur-exprimés étaient associés aux processus mitotiques, de réplication et de réparation d'ADN (p<0,05) alors que les gènes sous-exprimés étaient 15 associés au métabolisme des hépatocytes en faveur d'un profil glycolytique et lipogénique (p<0,05). L'analyse d'enrichissement montrait que les souris ASVB avaient des tumeurs qui s'apparentaient à des CHC prolifératifs et de mauvais pronostic, associées à des signatures de cellules progénitrices (|NES|>2 ; p<0,001). Une signature de 11 gènes a été créée pour caractériser l'oncogenèse de CHC murin SV40-induite. L'exposition à un régime SM provoquait une NAFLD dès 8 semaines avec des lésions d'inflammation limitées sans obésité quelque soit le phénotype des souris. Les souris ASVB avec SM activaient les voies de signalisation de TNF/NFkB (NES= 1.68 ; p=0,013) et RAS/MAPK (NES= 1,72 ; p<0,009), surexprimaient la lipocaline 2 (LogFoldChange= 1,28 ; p=0,017) et autres gènes associés à la transition épithélio-mésenchymateuse (NES=1.78 ; p=0,002) et à l'apoptose (NES=1,82 ; p=0,002). Leur foie était enrichi en cellules de Küpffer (NES>1,83 ; p<0,001), cellules endothéliales (NES=1,67 ; p=0,007) et cellules progénitrices biliaires EPCAM+ (NES=1,74 ; p=0,007). Conclusion : L'oncogenèse des souris ASVB est médiée par les voies E2F et MYC et induit une reprogrammation métabolique pertinente. Ces tumeurs s'apparentent aux CHC humains prolifératifs induits par le virus B et l'adjonction d'un régime SM modifie le profil cellulaire immunologique en faveur d'une immunité émoussée. ASVB est un modèle de CHC murin pertinent susceptible de promouvoir la compréhension métabolomique du CHC humain et le développement de nouvelles thérapeutiques ciblées. |